Bos taurus Gene: HDAC2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-631217.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HDAC2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | histone deacetylase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000011849 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
histone deacetylase 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] Histone deacetylase 2 (HDAC2) is part of a repressor complex, along with key components that include HDAC1, RE-1 silencing transcription factor (REST), co-repressor of REST (CoREST), and lysine-specific demethylase (LSD) 1. The HDAC/CoREST/REST/LSD1 repressor complex is a significant component of host innate immunity.
[Homo sapiens] TET2 selectively mediates active repression of IL6 transcription via NFKBIZ and HDAC2 during inflammation resolution in innate myeloid cells, including dendritic cells and macrophages.
[Mus musculus] Tet2 selectively mediates active repression of Il6 transcription via Nfkbiz and Hdac2 during inflammation resolution in innate myeloid cells, including dendritic cells and macrophages.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000196591:
This gene product belongs to the histone deacetylase family. Histone deacetylases act via the formation of large multiprotein complexes, and are responsible for the deacetylation of lysine residues at the N-terminal regions of core histones (H2A, H2B, H3 and H4). This protein forms transcriptional repressor complexes by associating with many different proteins, including YY1, a mammalian zinc-finger transcription factor. Thus, it plays an important role in transcriptional regulation, cell cycle progression and developmental events. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Apr 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:36918529-36952928 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 387 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
Notch pathway
TNFalpha pathway
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REACTOME |
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
p75NTR negatively regulates cell cycle via SC1 pathway
NOTCH1 Intracellular Domain Regulates Transcription pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants pathway
RNA Polymerase I Transcription Initiation pathway
Signalling by NGF pathway
Signaling by NOTCH1 t(7;9)(NOTCH1:M1580_K2555) Translocation Mutant pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
Signaling by NOTCH1 in Cancer pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
p75 NTR receptor-mediated signalling pathway
FBXW7 Mutants and NOTCH1 in Cancer pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
Signal Transduction pathway
Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants in Cancer pathway
HDACs deacetylate histones pathway
Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Chromatin organization pathway
Signaling by NOTCH pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Signaling by NOTCH1 pathway
Signaling by NOTCH1 HD Domain Mutants in Cancer pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Gene Expression pathway
Disease pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
Hemostasis pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Mus musculus biological processes pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
Chromatin organization pathway
Hemostasis pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
Signalling by NGF pathway
Gene Expression pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
Signal Transduction pathway
p75 NTR receptor-mediated signalling pathway
HDACs deacetylate histones pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
p75NTR negatively regulates cell cycle via SC1 pathway
RNA Polymerase I Transcription Initiation pathway
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KEGG |
Cell cycle pathway
Notch signaling pathway pathway
Chronic myeloid leukemia pathway
Huntington's disease pathway
Pathways in cancer pathway
Notch signaling pathway pathway
Cell cycle pathway
Chronic myeloid leukemia pathway
Huntington's disease pathway
Pathways in cancer pathway
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INOH |
TGF-beta signaling pathway
TGF-beta signaling pathway
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PID NCI |
Direct p53 effectors
Signaling events mediated by HDAC Class I
Glucocorticoid receptor regulatory network
Regulation of nuclear SMAD2/3 signaling
Hedgehog signaling events mediated by Gli proteins
Regulation of Telomerase
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1MFZ7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 407223 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02025850 DAAA02025851 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 407223 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||