Homo sapiens Gene: MSH6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-51044.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | MSH6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | mutS homolog 6 (E. coli) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | GTBP; GTMBP; HNPCC5; HSAP; p160 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000116062 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
mutS homolog 6 (E. coli)
mutS homolog 6 (E. coli)
mutS homolog 6 (E. coli)
mutS homolog 6 (E. coli)
mutS homolog 6 (E. coli)
mutS homolog 6 (E. coli)
mutS homolog 6 (E. coli)
mutS homolog 6 (E. coli)
mutS homolog 6
mutS homolog 6
mutS homolog 6
mutS homolog 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein similar to the MutS protein. In E. coli, the MutS protein helps in the recognition of mismatched nucleotides, prior to their repair. A highly conserved region of approximately 150 aa, called the Walker-A adenine nucleotide binding motif, exists in MutS homologs. The encoded protein of this gene combines with MSH2 to form a mismatch recognition complex that functions as a bidirectional molecular switch that exchanges ADP and ATP as DNA mismatches are bound and dissociated. Mutations in this gene have been identified in individuals with hereditary nonpolyposis colon cancer (HNPCC) and endometrial cancer. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a member of the DNA mismatch repair MutS family. In E. coli, the MutS protein helps in the recognition of mismatched nucleotides prior to their repair. A highly conserved region of approximately 150 aa, called the Walker-A adenine nucleotide binding motif, exists in MutS homologs. The encoded protein heterodimerizes with MSH2 to form a mismatch recognition complex that functions as a bidirectional molecular switch that exchanges ADP and ATP as DNA mismatches are bound and dissociated. Mutations in this gene may be associated with hereditary nonpolyposis colon cancer, colorectal cancer, and endometrial cancer. Transcripts variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:47695530-47810101 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p16.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 86 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH6 (MutSalpha) pathway
Mismatch Repair pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
Colorectal cancer pathway
Mismatch repair pathway
Pathways in cancer pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000179 NM_001281492 NM_001281493 NM_001281494 XM_005264271 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS1836 CCDS62906 CCDS62907 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||