Homo sapiens Gene: NPM1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-57453.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NPM1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | nucleophosmin (nucleolar phosphoprotein B23, numatrin) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | B23; NPM | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000181163 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
nucleophosmin (nucleolar phosphoprotein B23, numatrin)
nucleophosmin (nucleolar phosphoprotein B23, numatrin)
nucleophosmin (nucleolar phosphoprotein B23, numatrin)
nucleophosmin (nucleolar phosphoprotein B23, numatrin)
nucleophosmin (nucleolar phosphoprotein B23, numatrin)
nucleophosmin (nucleolar phosphoprotein B23, numatrin)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a phosphoprotein which moves between the nucleus and the cytoplasm. The gene product is thought to be involved in several processes including regulation of the ARF/p53 pathway. A number of genes are fusion partners have been characterized, in particular the anaplastic lymphoma kinase gene on chromosome 2. Mutations in this gene are associated with acute myeloid leukemia. More than a dozen pseudogenes of this gene have been identified. Alternative splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Nov 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:171387116-171411137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q35.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 440 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 38 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Deposition of new CENPA-containing nucleosomes at the centromere pathway
Nuclear import of Rev protein pathway
Chromosome Maintenance pathway
Nucleosome assembly pathway
Cell Cycle pathway
HIV Infection pathway
Host Interactions of HIV factors pathway
Interactions of Rev with host cellular proteins pathway
Disease pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Validated targets of C-MYC transcriptional activation
HIF-1-alpha transcription factor network
Aurora B signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P06748 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E5RI98 Q9NX34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 4869 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.573436 Hs.600877 Hs.634598 Hs.647621 Hs.667403 Hs.735618 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001037738 NM_002520 NM_199185 XM_006714869 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:7910 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 164040 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS43399 CCDS4376 CCDS4377 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB042278 AB451236 AB451361 AC091980 AC093246 AK000472 AK290652 AY347529 AY740634 AY740635 AY740636 AY740637 AY740638 AY740639 AY740640 BC002398 BC008495 BC009623 BC012566 BC014349 BC016716 BC016768 BC016824 BC021668 BC021983 BC050628 BC107754 BT007011 CH471062 D45915 DQ303464 J02590 M23613 M26697 M28699 M31004 U04946 U41742 U41743 U89309 U89310 U89311 U89313 U89314 U89317 U89319 U89321 X16934 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA36380 AAA36385 AAA36473 AAA36474 AAA58386 AAA58698 AAB00112 AAB00113 AAB94739 AAH02398 AAH08495 AAH09623 AAH12566 AAH14349 AAH16716 AAH16768 AAH16824 AAH21668 AAH21983 AAH50628 AAI07755 AAP35657 AAQ24860 AAW67752 AAW67753 AAW67754 AAW67755 AAW67756 AAW67757 AAW67758 ABC40399 BAA08343 BAA91188 BAB40600 BAF83341 BAG70050 BAG70175 CAA34809 EAW61443 EAW61446 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 4869 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||