Mus musculus Protein: Irf1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-172255.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Irf1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | interferon regulatory factor 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AU020929; Irf-1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000019043 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-172251 (Irf1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Transcriptional regulator which displays a remarkable functional diversity in the regulation of cellular responses. These include the regulation of IFN and IFN-inducible genes, host response to viral and bacterial infections, regulation of many genes expressed during hematopoiesis, inflammation, immune responses and cell proliferation and differentiation, regulation of the cell cycle and induction of growth arrest and programmed cell death following DNA damage. Stimulates both innate and acquired immune responses through the activation of specific target genes and can act as a transcriptional activator and repressor regulating target genes by binding to an interferon- stimulated response element (ISRE) in their promoters. Its target genes for transcriptional activation activity are: genes involved in anti-viral response, such as IFN-alpha/beta, DDX58/RIG-I, TNFSF10/TRAIL, OAS1/2, PIAS1/GBP, EIF2AK2/PKR and RSAD2/viperin; antibacterial response, such as NOS2/INOS; anti-proliferative response, such as p53/TP53, LOX and CDKN1A; apoptosis, such as BBC3/PUMA, CASP1, CASP7 and CASP8; immune response, such as IL7, IL12A/B and IL15, PTGS2/COX2 and CYBB; DNA damage responses and DNA repair, such as POLQ/POLH; MHC class I expression, such as TAP1, PSMB9/LMP2, PSME1/PA28A, PSME2/PA28B and B2M and MHC class II expression, such as CIITA. Represses genes involved in anti- proliferative response, such as BIRC5/survivin, CCNB1, CCNE1, CDK1, CDK2 and CDK4 and in immune response, such as FOXP3, IL4, ANXA2 and TLR4. Stimulates p53/TP53-dependent transcription through enhanced recruitment of EP300 leading to increased acetylation of p53/TP53. Plays an important role in immune response directly affecting NK maturation and activity, macrophage production of IL12, Th1 development and maturation of CD8+ T- cells. Also implicated in the differentiation and maturation of dendritic cells and in the suppression of regulatory T (Treg) cells development. Acts as a tumor suppressor and plays a role not only in antagonism of tumor cell growth but also in stimulating an immune response against tumor cells. {ECO:0000269PubMed:12387893, ECO:0000269PubMed:17018642, ECO:0000269PubMed:18641303, ECO:0000269PubMed:18955028, ECO:0000269PubMed:20308629, ECO:0000269PubMed:21909274}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:17018642}. Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:17018642}. Note=MYD88-associated IRF1 migrates into the nucleus more efficiently than non-MYD88- associated IRF1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 83 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 120 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:96590 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001346
Interferon regulatory factor DNA-binding domain IPR017431 Interferon regulatory factor-1/2 |
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PFAM |
PF00605
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PRINTS |
PR00267
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PIRSF |
PIRSF038196
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SMART |
SM00348
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P15314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P15314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5SX16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 16362 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.399626 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001152868 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | 1IF1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Irf1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS24686 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK152005 AK152104 AK155983 AK157347 AL596182 BC003821 CH466575 M21065 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA39334 AAH03821 BAE30869 BAE30951 BAE33535 BAE34056 EDL33569 EDL33570 EDL33571 EDL33572 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||