Mus musculus Gene: Chd3 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-190457.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Chd3 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | chromodomain helicase DNA binding protein 3 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000018474 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chromodomain helicase DNA binding protein 3
chromodomain helicase DNA binding protein 3
chromodomain helicase DNA binding protein 3
chromodomain helicase DNA binding protein 3
chromodomain helicase DNA binding protein 3
chromodomain helicase DNA binding protein 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000170004:
This gene encodes a member of the CHD family of proteins which are characterized by the presence of chromo (chromatin organization modifier) domains and SNF2-related helicase/ATPase domains. This protein is one of the components of a histone deacetylase complex referred to as the Mi-2/NuRD complex which participates in the remodeling of chromatin by deacetylating histones. Chromatin remodeling is essential for many processes including transcription. Autoantibodies against this protein are found in a subset of patients with dermatomyositis. Three alternatively spliced transcripts encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:69343273-69369406 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 121 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
RNA Polymerase I Transcription Initiation pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
HDACs deacetylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Gene Expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling events mediated by HDAC Class I
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.178246 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_146019 XM_006532884 XM_006532885 XM_006532886 XM_006532888 XM_006532890 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS48825 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||