Mus musculus Gene: Trp53 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-191036.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Trp53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | transformation related protein 53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | bbl; bfy; bhy; p44; p53; Tp53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000059552 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
transformation related protein 53
transformation related protein 53
transformation related protein 53
transformation related protein 53
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Tpr53 serves as a host antiviral factor and enhances both the innate and adaptive immune responses to influenza A virus.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] TP53 binds to canonical and non-canonical promoter regions of the human TLR gene family and up-regulates the expression of TLRs. The activation of TP53 can directly influence the TLR-mediated induction of cytokines.
[Homo sapiens] TP53 serves as a host antiviral factor and enhances both the innate and adaptive immune responses to influenza A virus. (Demonstrated in mice)
[Homo sapiens] Coronavirus engages papain-like proteases to escape from the innate antiviral response of the host by inhibiting TP53-IRF7-IFNB1 signalling.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes tumor protein p53, which responds to diverse cellular stresses to regulate target genes that induce cell cycle arrest, apoptosis, senescence, DNA repair, or changes in metabolism. p53 protein is expressed at low level in normal cells and at a high level in a variety of transformed cell lines, where it's believed to contribute to transformation and malignancy. p53 is a DNA-binding protein containing transcription activation, DNA-binding, and oligomerization domains. It is postulated to bind to a p53-binding site and activate expression of downstream genes that inhibit growth and/or invasion, and thus function as a tumor suppressor. Mice deficient for this gene are developmentally normal but are susceptible to spontaneous tumors. Evidence to date shows that this gene contains one promoter, in contrast to alternative promoters of the human gene, and transcribes a few of splice variants which encode different isoforms, although the biological validity or the full-length nature of some variants has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes tumor protein p53, which responds to diverse cellular stresses to regulate target genes that induce cell cycle arrest, apoptosis, senescence, DNA repair, or changes in metabolism. p53 protein is expressed at low level in normal cells and at a high level in a variety of transformed cell lines, where it\'s believed to contribute to transformation and malignancy. p53 is a DNA-binding protein containing transcription activation, DNA-binding, and oligomerization domains. It is postulated to bind to a p53-binding site and activate expression of downstream genes that inhibit growth and/or invasion, and thus function as a tumor suppressor. Mice deficient for this gene are developmentally normal but are susceptible to spontaneous tumors. Evidence to date shows that this gene contains one promoter, in contrast to alternative promoters of the human gene, and transcribes a few of splice variants which encode different isoforms, although the biological validity or the full-length nature of some variants has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:69580359-69591873 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | B3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 164 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 644 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Autodegradation of the E3 ubiquitin ligase COP1 pathway
Oxidative Stress Induced Senescence pathway
Hemostasis pathway
Cellular responses to stress pathway
Oncogene Induced Senescence pathway
DNA Damage/Telomere Stress Induced Senescence pathway
p53-Dependent G1 DNA Damage Response pathway
p53-Dependent G1/S DNA damage checkpoint pathway
Cell Cycle pathway
Stabilization of p53 pathway
Cell Cycle Checkpoints pathway
Cellular Senescence pathway
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
G1/S DNA Damage Checkpoints pathway
Formation of Senescence-Associated Heterochromatin Foci (SAHF) pathway
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KEGG |
Endometrial cancer pathway
Bladder cancer pathway
Basal cell carcinoma pathway
p53 signaling pathway pathway
Wnt signaling pathway pathway
Colorectal cancer pathway
Thyroid cancer pathway
Melanoma pathway
Cell cycle pathway
MAPK signaling pathway pathway
Glioma pathway
Small cell lung cancer pathway
Apoptosis pathway
Prostate cancer pathway
Chronic myeloid leukemia pathway
Non-small cell lung cancer pathway
Pancreatic cancer pathway
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
Huntington's disease pathway
Pathways in cancer pathway
Hepatitis C pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
TGF_beta_Receptor pathway
TNFalpha pathway
Oncostatin_M pathway
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REACTOME |
Transcriptional activation of cell cycle inhibitor p21 pathway
Autodegradation of the E3 ubiquitin ligase COP1 pathway
Stabilization of p53 pathway
p53-Dependent G1 DNA Damage Response pathway
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
Pre-NOTCH Transcription and Translation pathway
Activation of NOXA and translocation to mitochondria pathway
Activation of PUMA and translocation to mitochondria pathway
p53-Dependent G1/S DNA damage checkpoint pathway
Cellular responses to stress pathway
Oncogene Induced Senescence pathway
Pre-NOTCH Expression and Processing pathway
Formation of Senescence-Associated Heterochromatin Foci (SAHF) pathway
Apoptosis pathway
Signal Transduction pathway
Cell Cycle pathway
DNA Damage/Telomere Stress Induced Senescence pathway
Transcriptional activation of p53 responsive genes pathway
Activation of BH3-only proteins pathway
Cellular Senescence pathway
Signaling by NOTCH pathway
Intrinsic Pathway for Apoptosis pathway
G1/S DNA Damage Checkpoints pathway
Oxidative Stress Induced Senescence pathway
Hemostasis pathway
Cell Cycle Checkpoints pathway
Oncogene Induced Senescence pathway
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
Stabilization of p53 pathway
G1/S DNA Damage Checkpoints pathway
Cellular responses to stress pathway
Hemostasis pathway
Cell Cycle pathway
Cellular Senescence pathway
Oxidative Stress Induced Senescence pathway
Autodegradation of the E3 ubiquitin ligase COP1 pathway
p53-Dependent G1 DNA Damage Response pathway
Formation of Senescence-Associated Heterochromatin Foci (SAHF) pathway
p53-Dependent G1/S DNA damage checkpoint pathway
Cell Cycle Checkpoints pathway
DNA Damage/Telomere Stress Induced Senescence pathway
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KEGG |
Colorectal cancer pathway
Non-small cell lung cancer pathway
Wnt signaling pathway pathway
Cell cycle pathway
Apoptosis pathway
MAPK signaling pathway pathway
Melanoma pathway
Thyroid cancer pathway
Endometrial cancer pathway
Bladder cancer pathway
Glioma pathway
Small cell lung cancer pathway
Prostate cancer pathway
Basal cell carcinoma pathway
Chronic myeloid leukemia pathway
Pancreatic cancer pathway
p53 signaling pathway pathway
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
Huntington's disease pathway
Pathways in cancer pathway
Hepatitis C pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
PLK3 signaling events
Aurora A signaling
Direct p53 effectors
Validated targets of C-MYC transcriptional activation
LKB1 signaling events
p53 pathway
AP-1 transcription factor network
Glucocorticoid receptor regulatory network
p75(NTR)-mediated signaling
Signaling events mediated by HDAC Class III
Signaling mediated by p38-alpha and p38-beta
Hypoxic and oxygen homeostasis regulation of HIF-1-alpha
BARD1 signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A5JTV6 A6YM30 Q3UGQ1 Q549C9 Q6TDG9 Q8C526 Q9JLE1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 22059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.474963 Mm.487603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_011640 XM_006533157 XM_006533158 NM_001127233 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36193 CCDS48826 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:98834 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Trp53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB017815 AB017816 AB020317 AB021961 AF151353 AF161020 AF190269 AK079711 AK138777 AK147815 AL731687 AY423848 BC005448 CH466601 EF570972 EF634061 EU031806 M13872 M13873 M13874 S77930 X00741 X00876 X00877 X00878 X00879 X00880 X00881 X00882 X00883 X00884 X00885 X01237 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA39881 AAA39882 AAA39883 AAB21108 AAD39535 AAD44340 AAF43276 AAH05448 AAR00340 ABQ44583 ABR29561 ABS81351 BAA82339 BAA82340 BAA82343 BAA82344 BAC37729 BAE23775 BAE28156 CAA25323 CAA25420 CAA25625 EDL10507 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 22059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||