Bos taurus Gene: TP53 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-635147.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TP53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Cellular tumor antigen p53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000001069 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Cellular tumor antigen p53
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] TP53 binds to canonical and non-canonical promoter regions of the human TLR gene family and up-regulates the expression of TLRs. The activation of TP53 can directly influence the TLR-mediated induction of cytokines.
[Homo sapiens] TP53 serves as a host antiviral factor and enhances both the innate and adaptive immune responses to influenza A virus. (Demonstrated in mice)
[Homo sapiens] Coronavirus engages papain-like proteases to escape from the innate antiviral response of the host by inhibiting TP53-IRF7-IFNB1 signalling.
[Mus musculus] Tpr53 serves as a host antiviral factor and enhances both the innate and adaptive immune responses to influenza A virus.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000141510:
This gene encodes a tumor suppressor protein containing transcriptional activation, DNA binding, and oligomerization domains. The encoded protein responds to diverse cellular stresses to regulate expression of target genes, thereby inducing cell cycle arrest, apoptosis, senescence, DNA repair, or changes in metabolism. Mutations in this gene are associated with a variety of human cancers, including hereditary cancers such as Li-Fraumeni syndrome. Alternative splicing of this gene and the use of alternate promoters result in multiple transcript variants and isoforms. Additional isoforms have also been shown to result from the use of alternate translation initiation codons (PMIDs: 12032546, 20937277). [provided by RefSeq, Feb 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:27985495-27997841 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 639 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Oncogene Induced Senescence pathway
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
Stabilization of p53 pathway
G1/S DNA Damage Checkpoints pathway
Cellular responses to stress pathway
Hemostasis pathway
Cell Cycle pathway
Cellular Senescence pathway
Oxidative Stress Induced Senescence pathway
Autodegradation of the E3 ubiquitin ligase COP1 pathway
p53-Dependent G1 DNA Damage Response pathway
Formation of Senescence-Associated Heterochromatin Foci (SAHF) pathway
p53-Dependent G1/S DNA damage checkpoint pathway
Cell Cycle Checkpoints pathway
DNA Damage/Telomere Stress Induced Senescence pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
TGF_beta_Receptor pathway
TNFalpha pathway
Oncostatin_M pathway
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REACTOME |
Transcriptional activation of cell cycle inhibitor p21 pathway
Autodegradation of the E3 ubiquitin ligase COP1 pathway
Stabilization of p53 pathway
p53-Dependent G1 DNA Damage Response pathway
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
Pre-NOTCH Transcription and Translation pathway
Activation of NOXA and translocation to mitochondria pathway
Activation of PUMA and translocation to mitochondria pathway
p53-Dependent G1/S DNA damage checkpoint pathway
Cellular responses to stress pathway
Oncogene Induced Senescence pathway
Pre-NOTCH Expression and Processing pathway
Formation of Senescence-Associated Heterochromatin Foci (SAHF) pathway
Apoptosis pathway
Signal Transduction pathway
Cell Cycle pathway
DNA Damage/Telomere Stress Induced Senescence pathway
Transcriptional activation of p53 responsive genes pathway
Activation of BH3-only proteins pathway
Cellular Senescence pathway
Signaling by NOTCH pathway
Intrinsic Pathway for Apoptosis pathway
G1/S DNA Damage Checkpoints pathway
Oxidative Stress Induced Senescence pathway
Hemostasis pathway
Cell Cycle Checkpoints pathway
Autodegradation of the E3 ubiquitin ligase COP1 pathway
Oxidative Stress Induced Senescence pathway
Hemostasis pathway
Cellular responses to stress pathway
Oncogene Induced Senescence pathway
DNA Damage/Telomere Stress Induced Senescence pathway
p53-Dependent G1 DNA Damage Response pathway
p53-Dependent G1/S DNA damage checkpoint pathway
Cell Cycle pathway
Stabilization of p53 pathway
Cell Cycle Checkpoints pathway
Cellular Senescence pathway
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
G1/S DNA Damage Checkpoints pathway
Formation of Senescence-Associated Heterochromatin Foci (SAHF) pathway
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KEGG |
Colorectal cancer pathway
Non-small cell lung cancer pathway
Wnt signaling pathway pathway
Cell cycle pathway
Apoptosis pathway
MAPK signaling pathway pathway
Melanoma pathway
Thyroid cancer pathway
Endometrial cancer pathway
Bladder cancer pathway
Glioma pathway
Small cell lung cancer pathway
Prostate cancer pathway
Basal cell carcinoma pathway
Chronic myeloid leukemia pathway
Pancreatic cancer pathway
p53 signaling pathway pathway
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
Huntington's disease pathway
Pathways in cancer pathway
Hepatitis C pathway
Endometrial cancer pathway
Bladder cancer pathway
Basal cell carcinoma pathway
p53 signaling pathway pathway
Wnt signaling pathway pathway
Colorectal cancer pathway
Thyroid cancer pathway
Melanoma pathway
Cell cycle pathway
MAPK signaling pathway pathway
Glioma pathway
Small cell lung cancer pathway
Apoptosis pathway
Prostate cancer pathway
Chronic myeloid leukemia pathway
Non-small cell lung cancer pathway
Pancreatic cancer pathway
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
Huntington's disease pathway
Pathways in cancer pathway
Hepatitis C pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
PLK3 signaling events
Aurora A signaling
Direct p53 effectors
Validated targets of C-MYC transcriptional activation
LKB1 signaling events
p53 pathway
AP-1 transcription factor network
Glucocorticoid receptor regulatory network
p75(NTR)-mediated signaling
Signaling events mediated by HDAC Class III
Signaling mediated by p38-alpha and p38-beta
Hypoxic and oxygen homeostasis regulation of HIF-1-alpha
BARD1 signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P67939 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1SY23 Q5I2N4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 281542 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.49712 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_174201 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB571118 AY859499 BC102440 D49825 DQ656490 X81704 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI02441 AAW56713 ABG37911 BAA08629 BAK09367 CAA57348 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 281542 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||