Mus musculus Protein: 4921501E09Rik | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-166870.7 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | 4921501E09Rik | ||||||||||||||||||||||||
Protein Name | RIKEN cDNA 4921501E09 gene | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | PHF8; | ||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000024121 | ||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-166868 (4921501E09Rik) | ||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||
Function | Histone lysine demethylase with selectivity for the di- and monomethyl states that plays a key role cell cycle progression, rDNA transcription and brain development. Demethylates mono- and dimethylated histone H3 'Lys-9' residue (H3K9Me1 and H3K9Me2), dimethylated H3 'Lys-27' (H3K27Me2) and monomethylated histone H4 'Lys-20' residue (H4K20Me1). Acts as a transcription activator as H3K9Me1, H3K9Me2, H3K27Me2 and H4K20Me1 are epigenetic repressive marks. Involved in cell cycle progression by being required to control G1-S transition. Acts as a coactivator of rDNA transcription, by activating polymerase I (pol I) mediated transcription of rRNA genes. Required for brain development, probably by regulating expression of neuron-specific genes. Has activity toward H4K20Me1 only when nucleosome is used as a substrate and when not histone octamer is used as substrate. May also have weak activity toward dimethylated H3 'Lys-36' (H3K36Me2), however, the relevance of this result remains unsure in vivo. Specifically binds trimethylated 'Lys-4' of histone H3 (H3K4me3), affecting histone demethylase specificity: has weak activity toward H3K9Me2 in absence of H3K4me3, while it has high activity toward H3K9me2 when binding H3K4me3 (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. Nucleus, nucleolus {ECO:0000250}. Note=Recruited to H3K4me3 sites on chromatin during interphase. Dissociates from chromatin when cells enter mitosis (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1921292 | ||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001965
Zinc finger, PHD-type IPR003347 JmjC domain IPR011011 Zinc finger, FYVE/PHD-type IPR019787 Zinc finger, PHD-finger |
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PFAM |
PF02373
PF08007 PF00628 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00249
SM00558 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q80TJ7 | ||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q80TJ7 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 74042 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.84774 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001009544 | ||||||||||||||||||||||||
MGI ID | 1WEP | ||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | 4921501E09Rik | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS28624 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF528164 AK036609 AK040943 AK040969 AK122447 AL662922 AL840642 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAO17385 BAC29505 BAC30755 BAC30763 BAC65729 CAM15464 CAM17159 CAM17161 CAM17163 | ||||||||||||||||||||||||