Homo sapiens Gene: PHF21A | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-41419.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PHF21A | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | PHD finger protein 21A | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000135365 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
PHD finger protein 21A
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The PHF21A gene encodes BHC80, a component of a BRAF35 (MIM 605535)/histone deacetylase (HDAC; see MIM 601241) complex (BHC) that mediates repression of neuron-specific genes through the cis-regulatory element known as repressor element-1 (RE1) or neural restrictive silencer (NRS) (Hakimi et al., 2002 [PubMed 12032298]).[supplied by OMIM, Nov 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:45929323-46121178 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p11.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 24 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production pathway
HDACs deacetylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Hemostasis pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.502458 Hs.597222 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001101802 NM_016621 XM_005252962 XM_005252963 XM_005252964 XM_005252965 XM_005252967 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31474 CCDS44578 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||